中华急诊医学杂志  2017, Vol. 26 Issue (6): 632-636
蛋白C基因变异与汉族人群急性呼吸窘迫综合征的易感性相关
张瑾, 童朝阳, 尹俊, 孙思, 宋振举     
200032 上海,复旦大学附属中山医院急诊科
摘要: 目的 探讨蛋白C (protein C, PC) 和内皮细胞活化蛋白C受体 (endothelial proteinCreceptor, EPCR) 基因变异与汉族人群急性呼吸窘迫综合征 (acute respiratory distress syndrome, ARDS) 遗传易感和预后相关性。 方法 收集275例ARDS患者和337例对照患者 (入住ICU,具有ARDS发病的高危因素,而未进展至ARDS) 入选本研究。共选择PC和EPCR基因的5个tagSNPs进行研究,以SNPstream技术平台进行分型。ELISA方法测定血浆活化蛋白C (activated protein C, APC) 的浓度。 结果 PC基因rs1799809和rs1158867高度连锁,且与ARDS的发病相关。rs1799809和rs1158867(T/C) 等位基因频率在ARDS组和对照组之间差异具有统计学意义 (P=0.00 11,P=0.00 16),ARDS组等位基因rs1799809T的频率为87.9%,明显高于对照组 (81.1%)(OR=1.569, 95%CI 1.192~2.066)。rs1799809基因型TT、TC和CC的频率在两组之间差异具有统计学意义 (P=0.007)。Haplotype分析发现由PC基因3个SNPs (rs1799809、rs1158867和rs2069912) 组成的单倍域与ARDS的发病明显相关,单倍型CCC的频率在两组之间差异具有统计学意义 (P=0.002),ARDS患者单倍型CCC的频率 (10.8%) 明显低于对照组 (16.9%)。另外研究发现携带rs1799809基因型TT的ARDS患者,外周血APC的浓度低于携带基因型TC和CC的患者 (Padj = 0.02)。EPCR基因的2个SNPs等位基因和基因型频率两组相比差异无统计学意义。 结论 PC基因变异与中国汉族人群ARDS的遗传易感性相关,其基因结构变异影响ARDS患者血浆APC的浓度。
关键词: 蛋白C     活化蛋白C     内皮细胞活化蛋白C受体     基因变异     SNPs     急性呼吸窘迫综合征     易感性     预后    
Protein C genetic variation was associated with the susceptibility to acute respiratory distress syndrome in Chinese Han population
Zhang Jin, Tong Chaoyang, Yin Jun, Sun Si, Song Zhenju     
Emergency Department, Zhongshan Hospital, Fudan University, Shanghai 200032, China
Corresponding author: Song Zhenju, Email: song.zhenju@zs-hospital.sh.cn
Abstract: Objective To investigate the genetic variants in the protein C (PC) and endothelial protein C receptor (EPCR) genes associated with the risk and outcome of acute respiratory distress syndrome (ARDS) patients in Chinese Han race. Methods Five tagSNPs (single nucleotide polymorphism, SNP) in the PC and EPCR genes were genotyped in patients with ARDS (n =275) and non-ARDS (n=337) in order to find the association between them in this case-control study. The SNPs were genotyped by SNPstream Beckman platform. Then, the correlation between the associated SNPs and plasma levels of activated proteinC(APC) in patients with ARDS was investigated. The APC levels were measured using enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) method. Results Association analysis revealed that two PC SNPs in perfect linkage disequilibrium, rs1799809 and rs1158867, were significantly associated with susceptibility to ARDS. T allele frequency of rs1799809 in ARDS patients was significantly higher than that in non-ARDS patients (OR=1.569, 95%CI: 1.192-2.066). And the genotype frequencies of rs1799809 were also significantly different between these two groups (P=0.007). The association remained significant after adjustment for multiple comparisons. Haplotype consisting of three SNPs in the PC gene was also associated with susceptibility to ARDS. The frequency of haplotype CCC in the ARDS samples was significantly lower than that in the non-ARDS group (P < 0.01). Moreover, ARDS patients carrying rs1799809 TT genotype showed lower serum levels of APC than patients with TC and CC genotypes (Padj=0.02). However, genotype and allele analyses of EPCR did not show any significant difference between ARDS and non-ARDS patients. Conclusions These findings indicated that common genetic variation in the PC gene was significantly associated with susceptibility to ARDS in Chinese Han race. The PC genetic variation influenced plasma concentration of APC in patients with ARDS.
Key words: PC     APC     EPCR     Genetic variation     SNPs     ARDS     Susceptibility     Prognosis    

炎症/抗炎症反应、凝血/纤溶系统失衡在ARDS的发病过程中具有重要的作用[1]。蛋白C (Protein C, PC) 通路是机体抗凝系统的重要组成部分。PC是一种存在于血液中的维生素K依赖性糖蛋白酶,在凝血酶-血栓调节蛋白复合物作用下活化为APC。APC与辅助因子蛋白S结合,灭活因子Ⅴa和Ⅶa,限制凝血酶的产生。EPCR是蛋白C系统新发现的成员,EPCR提供了PC激活区域,进一步增强蛋白C向APC转化。EPCR参与凝血、炎症、凋亡、保护内皮屏障以及免疫等诸多病理过程,有研究发现与脓毒症和ARDS的发病有关[2-3]。近年来,发现一些基因的遗传变异与ARDS的发病相关[4-6]。有关凝血与纤溶通路基因的遗传变异与ARDS关联研究报道较少。本研究选择PC和EPCR为候选基因,探讨两个基因的单核苷酸多态性 (single nucleotide polymorphism, SNP) 是否与ARDS的易感性和预后相关,并阐述其可能的机制。

1 资料与方法 1.1 一般资料

收集2006年6月至2016年8月复旦大学附属中山医院急诊ICU诊断为ARDS患者275例和337例病例对照患者入选本研究。ARDS的诊断标准严格按照1994年AECC制定的诊断标准[7]。病例对照组为同期入住ICU、具有ARDS发病的高危因素,但未进展至ARDS的患者,主要包括脓毒症、肺部感染、吸入性肺炎、外伤、大量输血等危重患者。ARDS组和疾病对照组患者的入选标准为:① 年龄≥18周岁;② 符合ARDS的诊断标准或具有ARDS患病的高危因素;③ 中国汉族人群;④ 患者之间无血缘关系;⑤ 病史资料、临床实验室和辅助检查结果齐全。排除标准包括:① 患自身免疫性疾病或者获得性免疫缺陷病;② 恶性肿瘤;③ 近期接受化疗或者放疗;④ 患严重的慢性呼吸系统疾病;⑤ 严重的慢性肝脏疾病 (Child-Pugh评分>10分)。本研究获得复旦大学附属中山医院伦理委员会的批准 (No: 2006-23)。

收集患者ARDS诊断后24 h内的资料,包括:感染部位、血白细胞计数和分类、血小板计数、血糖、血肌酐、血氧分压、氧合指数等生化检测指标和体温、心率、血压、呼吸频率、主要的治疗措施等临床记录。收集入选者的人口学资料、吸烟状况、发病原因、就诊时间、用药史、慢性病史和家族史等资料。采用APACHE Ⅱ评分系统对患者的严重程度进行评价。

1.2 tagSNPs的选择和分型

根据Hapmap中国人群数据库选择PC和EPCR 2个基因的tag SNPs,共选择5个tagSNPs进行研究 (PC基因-rs1799809, rs1158867, rs2069912;EPCR基因-rs2069948,rs867186)。采用SNPstream的方法 (Beckman技术平台) 对SNP位点进行检测和分型。根据检测到的杂交反应荧光的不同,判断相应样本SNP等位基因型。

1.3 外周血的分离和ELISA测定APC浓度

为进一步探讨rs1799809基因型对APC浓度的影响,收集51例rs1799809不同基因型的ARDS患者、入院24 h内的外周静脉血5 mL、肝素抗凝,室温下放置30 min后,4 ℃、3 000 r/min离心10 min,取上清液-80 ℃保存备用。采用ELISA方法对血浆中APC浓度进行检测。ELISA测定试剂盒购自美国Sigma公司,具体操作步骤按说明书进行。

1.4 统计学方法

计量数据以均数±标准差 (x±s) 表示,各组之间的比较采用Mann-Whitney U检验。基因型频率和等位基因频率在病例组和对照组间的差异以χ2检验或者Fisher's确切概率法检验,并计算等位基因频率的OR值和95%CI。各组基因型的比较采用Global genotype检验。运用多元Logistic回归分析方法对影响ARDS患者APC浓度的混杂因素进行校正。所有的统计均采用Bonferroni法进行多重检验校正。多个SNPs之间的LD值用Haploview v4.1软件计算r2值,运用Haploview v4.1软件EM方法和PLINK软件omnibus法进行计算、比较单倍型分布。所有统计学分析均采用SPSS 17.0软件,双侧检验,以P<0.05为差异具有统计学意义。

2 结果 2.1 入组患者的一般资料

研究期间共入选ARDS患者275例,另外收集同期入住ICU、具有ARDS发病的高危因素但未进展至ARDS的337例重症患者作为疾病对照组。所有患者的一般资料见表 1。ARDS主要诱因包括:肺部感染、脓毒症、创伤、误吸等。ARDS组与非ARDS组相比,在性别、年龄、BMI、吸烟史、肝脏病史、糖尿病发病率等方面差异无统计学意义 (P>0.05),但ARDS组患者APACHE Ⅱ评分和病死率均明显高于非ARDS组 (P < 0.01)。死亡组患者APACHE Ⅱ评分明显高于存活组 (P=0.007),年龄和ARDS诱因等差异无统计学意义 (P>0.05)。

表 1 入组患者的基本资料 Table 1 The basic information of different groups patients
指标 ARDS组 非ARDS组 P1 ARDS存活组 ARDS死亡组 P2
例数 275 337 - 124 151 -
年龄 63.6 ± 12.7 64.2 ± 14.2 0.57 62.4 ± 12.3 64.6 ± 14.1 0.07
男性 (例,%) 165 (60) 197 (59.8) 0.69 76 (61.3) 89 (58.9) 0.69
BMI (kg·m-2) 23 ± 7 22 ± 7 0.23 22.8 ± 7.2 23.2 ± 6.9 0.16
糖尿病 (例,%) 44 (16) 46 (13.6) 0.42 23 (18.5) 21 (13.9) 0.29
肝脏病史 13 (4.7) 13 (3.9) 0.59 8 (6.5) 5 (3.3) 0.22
吸烟史 123 (44.7) 130 (38.6) 0.12 62 (50) 61 (40.4) 0.11
ARDS诱因
  肺部感染 114 (41.5) 164 (48.7) 0.08 50 (40.3) 64 (42.4) 0.73
  脓毒症 125 (45.5) 130 (38.6) 0.09 60 (48.4) 65 (43.1) 0.38
  创伤 22 (8) 22 (6.5) 0.48 8 (6.5) 14 (9.3) 0.39
  误吸 8 (2.9) 14 (4.2) 0.41 4 (3.2) 4 (2.6) 0.78
  其他 6 (2.2) 7 (2.1) 0.93 2 (1.6) 4 (2.6) 0.56
APACHE Ⅱ 19.6 ± 3.2 15.6 ± 2.5 < 0.01 18.7 ± 3.6 20.34 ± 4.5 0.007
病死率 (%) 54.9 33.3 < 0.01 - - -
注:P1 ARDS组VS非ARDS组;P2存活组VS死亡组
2.2 PC和EPCR基因tagSNPs和单倍型在ARDS和非ARDS患者中的分布

PC和EPCR基因SNPs的等位基因和基因型频率的分布见表 2。结果发现PC基因的2个SNPs:rs1799809和rs1158867高度连锁 (r2=0.93),2个SNPs的等位基因频率在ARDS组和非ARDS组差异具有统计学意义。ARDS患者携带等位基因rs1799809 T和rs1158867 T的频率明显高于非ARDS组患者 (P=0.001 1, OR=1.569; P=0.001 6, OR=1.588)。rs1799809和rs1158867基因型分布在两组差异具有统计学意义 (P=0.007, P=0.009)。另外研究发现,由PC基因3个SNPs即rs1799809、rs1158867和rs2069912组成的单倍型与ARDS患者的易感性有关。单倍型CCC的分布频率在ARDS患者组 (10.8%) 明显低于非ARDS患者组 (16.9%),差异具有统计学意义 (P=0.002),单倍型CCC对ARDS发病具有保护作用 (表 3)。然而,EPCR基因2个SNPs即rs2069948和rs867186无论等位基因频率和基因型频率分布在两组中差异无统计学意义。

表 2 ARDS和非ARDS患者PC和EPCR基因SNPs等位基因和基因型分布 Table 2 The allele and genotype frequencies of the SNPs within PC and EPCR genes in ARDS and non-ARDS patients
SNP 非ARDS组 ARDS组 P OR (95%CI)
PC
rs1799809 1.569 (1.192~2.066)
  TT 225 (67) 213 (77.8)
  TC 95 (28.3) 56 (20.4)
  CC 16 (4.8) 5 (1.8) 0.007a
  T 545 (81.1) 482 (87.9)
  C 127(18.9) 66 (12.1) 0.0011b
rs1158867 1.588 (1.177~2.063)
  TT 226 (67.7) 214 (78.4)
  TC 94 (28.1) 54 (19.8)
  CC 14 (4.2) 5 (1.8) 0.009a
  T 546 (81.7) 482 (88.3)
  C 122 (18.3) 64 (11.7) 0.0016b
rs2069912 1.082 (0.942~1.242)
  TT 106 (32.4) 93 (35.1)
  TC 163 (49.8) 135 (50.9)
  CC 58 (17.7) 37 (14.0) 0.439a
  T 375 (57.3) 321 (60.6)
  C 279 (42.7) 209 (39.4) 0.262b
EPCR
rs2069948 1.009 (0.862~1.181)
  GG 144 (43.3) 128 (46.9)
  GA 149 (44.9) 105 (38.5)
  AA 39 (11.7) 40 (14.6) 0.241a
  G 437 (65.8) 361 (66.1)
  A 227 (34.2) 185 (33.9) 0.912b
rs867186 0.993 (0.670~1.469)
  AA 287 (85.9) 234 (85.7)
  AG 43 (12.9) 36 (13.2)
  GG 4 (1.2) 3 (1.1) 0.988a
  A 617 (92.4) 504 (92.3)
  G 51 (7.6) 42 (7.7) 0.970 b
注:a等位基因频率分布比较,b基因型频率分布比较;5个SNPs,Bonferroni校正的P值为0.01即P<0.01为差异具有统计学意义
表 3 ARDS和非ARDS患者PC基因单倍型频率分布 Table 3 The PC gene haplotype frequencies in ARDS and non-ARDS patients
Haplotype ARDS组 非ARDS组 P1 死亡组 存活组 P2
TTT 0.604 0.569 0.178 0.573 0.58 0.871
TTC 0.279 0.259 0.221 0.270 0.265 0.890
CCC 0.108 0.169 0.002 0.140 0.152 0.713
注:P1:ARDS组vs.非ARDS组;P2:存活组vs.死亡组;3种单倍型,Bonferroni校正的P值为0.0166,差异具有统计学意义
2.3 PC和EPCR基因tagSNPs在不同预后的ARDS患者中的分布

为进一步探讨PC和EPCR基因变异与ARDS患者预后的相关性,ARDS患者分为存活组和死亡组,比较PC和EPCR基因5个tagSNPs的等位基因、基因型和单倍型频率在两组中的分布差异。结果发现PC和EPCR基因的5个SNPs等位基因和基因型频率以及rs1799809、rs1158867和rs2069912组成的单倍型频率在存活组和死亡组之间差异无统计学意义 (P < 0.05) (见表 3表 4)。PC和EPCR基因变异与ARDS患者的预后无明显的相关性。

表 4 不同预后ARDS患者PC和EPCR基因SNPs等位基因和基因型频率 Table 4 The allele and genotype frequencies of the SNPs within PC and EPCR genes in ARDS patients
SNP 存活组 死亡组 P OR (95%CI)
PC
rs1799809 1.523 (0.945~2.455)
  TT 111 (73.5) 102 (83)
  TC 37 (24.5) 19 (15.4)
  CC 3 (2.0) 2 (1.6) 0.108a
  T 259 (85.8) 223 (90.7)
  C 43 (14.2) 23 (9.3) 0.08b
rs1158867 1.565 (0.961~2.549)
  TT 111 (74.0) 103 (83.7)
  TC 36 (24.0) 18 (14.6)
  CC 3 (2.0) 2 (1.6) 0.145a
  T 258 (86.0) 224 (91.1)
  C 42 (14.0) 22 (8.9) 0.068b
rs2069912 1.104 (0.891~1.368)
  TT 50 (34.0) 43 (36.4)
  TC 73 (49.7) 62 (52.5)
  CC 24 (16.3) 13 (11.0) 0.463a
  T 173 (58.8) 148 (62.7)
  C 121 (41.2) 88 (37.3) 0.365b
EPCR
rs2069948 0.979 (0.774~1.238)
  GG 68 (45.6) 60 (48.4)
  GA 62 (41.6) 43 (34.7)
  AA 19 (12.8) 21 (16.9) 0.414a
  G 198 (66.4) 163 (65.7)
  A 100 (33.6) 85 (34.3) 0.860b
rs867186 1.093 (0.608~1.967)
  AA 128 (85.3) 106 (86.2)
  AG 20 (13.3) 16 (13.0)
  GG 2 (1.4) 1 (0.8) 0.915a
  A 276 (92.0) 228 (92.7)
  G 24 (8.0) 18 (7.3) 0.766b
注:a等位基因频率分布比较; b基因型频率分布比较
2.4 rs1799809基因型与ARDS患者血浆APC浓度的相关性

rs1799809位于PC基因的启动子区域,影响PC基因的表达。研究收集51例ARDS患者入院24 h内的血浆,TT、TC和CC基因型的患者分别为37例、12例和2例。结果发现携带基因型TT的患者血浆中APC的浓度明显低于基因型TC和CC的患者[(4.47 ± 0.99)μg/L vs.(5.83 ± 1.45)μg/L,P=0.006) (见图 1),Logistic回归分析去除年龄、APACHE Ⅱ评分等混杂因素后,差异具有统计学意义 (Padj=0.02)。

图 1 rs1799809不同基因型ARDS患者血浆APC浓度 Figure 1 The concentration of APC in different rs1799809 genotype patients
3 讨论

本研究发现凝血/纤溶通路关键基因-PC的SNPs和单倍型与中国汉族人群ARDS的易感性显著相关。即存在高危因素的情况下,携带rs1799809等位基因T个体更易患ARDS;同时研究也发现携带不同基因型的ARDS患者在发病初期血浆APC的浓度不同,携带基因型TT的患者血浆APC的浓度显著降低,这可能与基因遗传结构存在一定的相关性。过度和持续激活的炎症反应是ARDS发病的始动因素,此外凝血系统的激活和纤溶系统的失调促进了ARDS的发病和肺间质纤维化的形成;并且炎症和凝血系统相互促进,相互增强,导致病情进一步加重、微血栓形成,甚至多器官功能衰竭的发生。有研究发现,ARDS患者血浆中APC的水平降低,纤溶酶原激活物抑制因子1 (PAI-1) 增加,APC和PAI的浓度与患者的预后相关[3, 8]

目前国内外有关ARDS发病遗传易感性的研究主要集中在编码炎症介质的基因,凝血/纤溶通路的相关基因研究较少[1]。PC基因位于染色体2q13-14区域,近年来有研究发现位于启动子区域的2个SNPs即rs1799809和rs1799808以及它们组成的单倍型与血栓性疾病、脓毒症等疾病易感性有关[9-11]。Chen等[12]研究发现PC基因单倍型rs1799809T/rs1799808C与严重脓毒症的病情程度和预后显著相关,携带单倍型rs1799809T/rs1799808C的患者SOFA评分和病死率更高。随后,Russell等[13]研究证实与单倍型rs1799809T/rs1799808C高度连锁的rs2069912C与东亚人群严重脓毒症的病情程度、器官功能衰竭和不良预后相关。本研究发现携带rs1799809 T个体ARDS发病率更高,而且PC基因3个SNPs (其中包括rs1799809和rs2069912) 组成的单倍型也与ARDS的发病有关。因此,本研究也进一步证实了PC基因遗传变异与急性炎症反应相关的疾病 (如:脓毒症和ARDS) 等易感性和病情程度相关。rs1799809和rs1799808位于PC基因的启动子区域,影响PC基因的表达。Aiach等[9]研究发现rs1799809和rs1799808组成的单倍型与健康个体外周血PC的浓度相关,本研究也发现rs1799809基因型与ARDS患者血浆APC的浓度有关,携带等位基因型TT的患者血浆APC的浓度显著降低。APC浓度的降低导致了体内天然抗活性物质的减少,从而影响ARDS的发病。尽管有研究发现EPCR基因与高加索人ARDS患病易感性有关[14],但本研究未发现其与汉族人群的ARDS遗传易感性相关,可能是种群的遗传结构不同[15]。尽管本研究发现PC基因变异与汉族人群ARDS的易感性有关,但该研究为单中心的病例对照研究,入组患者相对偏少,尚需要进一步扩大样本量进行验证。另外,仅选择ICU具有ARDS发病高危因素的患者作为疾病对照组,没有设立健康对照组,存在一定的局限性。将来可以开展多中心前瞻性研究、扩大样本量、同时设立相匹配的健康对照组进一步对结果进行验证。

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